| 重粒子線 | 陽子線 | 都道府県 | 施設名称 |
| ● | 北海道 | 北海道大学病院陽子線治療センター | |
| ● | 北海道 | 札幌禎心会病院陽子線治療センター | |
| ● | 北海道 | 北海道大野記念病院 札幌高機能放射線治療センター | |
| ● | 山形県 | 山形大学医学部東日本重粒子センター | |
| ● | 福島県 | 南東北がん陽子線治療センター | |
| ● | 群馬県 | 群馬大学医学部附属病院 重粒子線医学研究センター | |
| ● | 茨城県 | 筑波大学附属病院 陽子線医学利用研究センター | |
| ● | 千葉県 | 国立がん研究センター東病院 | |
| ● | 千葉県 | 量子科学技術研究開発機構QST病院（旧放医研病院） | |
| ● | 神奈川県 | 神奈川県立がんセンター 重粒子線治療施設 | |
| ● | 長野県 | 相澤病院 陽子線治療センター | |
| ● | 静岡県 | 静岡県立静岡がんセンター | |
| ● | 愛知県 | 社会医療法人明陽会 成田記念陽子線センター | |
| ● | 愛知県 | 名古屋陽子線治療センター | |
| ● | 京都府 | 京都府立医科大学 永守記念最先端がん治療研究センター | |
| ● | 大阪府 | 大阪重粒子線センター | |
| ● | 大阪府 | 大阪陽子線クリニック | |
| ● | 奈良県 | 社会医療法人 高清会 陽子線治療センター | |
| ● | 福井県 | 福井県立病院 陽子線がん治療センター | |
| ● | ● | 兵庫県 | 兵庫県立粒子線医療センター |
| ● | 兵庫県 | 兵庫県立粒子線医療センター付属神戸陽子線センター | |
| ● | 岡山県 | 岡山大学・津山中央病院共同運用 がん陽子線治療センター | |
| ● | 佐賀県 | 九州国際重粒子線がん治療センター | |
| ● | 鹿児島県 | メディポリス国際陽子線治療センター |